Banque de séquences de Geniegen 2

Séquences et packs disponibles


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protéines   
ARN   
ADN

Séquences et packs sélectionnés

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Banque d'enzymes de restriction de Geniegen 2

Enzymes disponibles


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Enzymes sélectionnées

Ces enzymes apparaîtront dans le menu déroulant rapide, dans le panneau inférieur de l'écran principal. Cliquez sur un élément du tableau ci-dessous pour le retirer de votre sélection.

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Modification/édition d'une séquence



Modifier la séquence dans le champ ci-dessous puis cliquer sur le bouton "Appliquer" :


Appliquer
    
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Saisie manuelle ou copie/collage d'une séquence



Nom de la séquence :


Type de séquence :


Séquence (saisir ou coller dans le cadre ci-dessous la séquence de nucléotides / acides aminés) :
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P.COSENTINO / P.PILLOT

GenieGen 2

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Le saviez-vous ? Un clic droit sur le titre d'une séquence
permet d'accéder à des fonctions supplémentaires (BLAST par exemple).

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Informations sur cette séquence
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Modifier la séquence
Déplacer en haut de la liste
Remonter d'une ligne
Transcrire en ARN (brin non transcrit)
Transcrire en ARN (brin matrice/transcrit)
Traduire en protéine (depuis le début)
Traduire (depuis le 1er codon ATG)
Créer le brin complémentaire
Afficher la structure 3D
Rechercher (BLAST)
Supprimer
Histidine (His,H) #50
Substituer (remplacer) cet acide aminé
Insérer un acide aminé après
Insérer un acide aminé avant
Supprimer cet acide aminé


  
en %   
identités   
noms complets
Fichier
Edition
Actions
Affichage
Options
 P.Cosentino / P.Pillot, v0.0 (infos RGPD)
Ouvrir la banque de séquences (Alt B)
Saisir/coller une séquence
Exporter
►
A propos
Quitter l'application
Tout sélectionner (Ctrl A)
Tout désélectionner (Ctrl 0)
Copier les séquences sélectionnées (Ctrl C)
Supprimer les séquences sélectionnées (Suppr)
Supprimer toutes les séquences (Alt Suppr)
D'autres actions sont possibles par
un clic droit.
Décocher "Enzymes de restriction" pour
pouvoir à nouveau aligner les séquences.
Aligner les séquences (Alt A)
Réaliser un DotPlot (2 séquences)
Transcrire les séquences
►
Traduire les séquences
►
Convertir en brin complémentaire
Inverser les séquences
Enzymes de restriction
Seules les séquences sélectionnées seront
concernées par ces actions.
D'autres actions sont possibles par
un clic droit.
Brin complémentaire
Tableau du code génétique
Abréviations des acides aminés
Structure 3D (protéine)
Algorithme d'alignement
►
Caractère pour la délétion
►
Distances & phénogramme
►
Code acides aminés
►
Numérotation
►
Autoriser le décalage
Identités (après alignement)
►
Coloration des nucléotides
►
Coloration 3D
►
Plein écran
Nucléotide affiché
Point médian
Arrière plan coloré
Version pour daltonien
les séquences sélectionnées au format (.edi)
les séquences sélectionnées au format (.fasta)
le tableau de comparaison (.csv)
chaîne
résidu (acide aminé)
similarité (conservation)
Automatique (par défaut)
Needleman (ancienne version)
Needleman (classique)
Diagonal (+ rapide)
La séquence à l'écran correspond à celle du
  brin transcrit (ou brin matrice)
  brin non transcrit
à partir du début de la séquence
à partir du premier codon d'initiation
Méthode UPGMA (recommandé)
Méthode WPGMA
Ne compter les gaps qu'une fois
Distances relatives
Tiret haut
Tiret bas
Nucléotide
Résidu / codon
1 lettre
3 lettres