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Banque d'enzymes de restriction de Geniegen 2
Enzymes disponibles
Saisissez quelques lettres du nom de l'enzyme :
Enzymes sélectionnées
Ces enzymes apparaîtront dans le menu déroulant rapide, dans le panneau inférieur de l'écran principal.
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Modification/édition d'une séquence
Modifier la séquence dans le champ ci-dessous puis cliquer sur le bouton "Appliquer" :
Appliquer
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Saisie manuelle ou copie/collage d'une séquence
Nom de la séquence :
Type de séquence :
Séquence (saisir ou coller dans le cadre ci-dessous la séquence de nucléotides / acides aminés) :
Ajouter cette séquence
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C ⟹
OK
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Avertissement
Ceci est un avertissement
OK
Question
Ceci est une question
Oui
Non
Saisie de texte
Veuillez saisir le nouveau nom pour cette séquence :
OK
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P.COSENTINO / P.PILLOT
GenieGen 2
Que voulez-vous faire pour commencer ?
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Le saviez-vous ? Un clic droit sur le titre d'une séquence permet d'accéder à des fonctions supplémentaires (BLAST par exemple).
Veuillez patienter
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Informations sur cette séquence
Renommer
Modifier la séquence
Dupliquer la séquence
Déplacer en haut de la liste
Remonter d'une ligne
Transcrire en ARN (brin non transcrit)
Transcrire en ARN (brin matrice/transcrit)
Traduire en protéine (depuis le début)
Traduire (depuis le 1er codon ATG)
Créer le brin complémentaire
Afficher la structure 3D
Rechercher (BLAST)
Tracer un profil d'hydropathie
Supprimer
Histidine (His,H) #50
Substituer (remplacer) cet acide aminé
Insérer un acide aminé après
Insérer un acide aminé avant
Supprimer cet acide aminé
Séquences chargées
similaires
différentes
Rappel : afin de pouvoir comparer les séquences sélectionnées en tenant compte des discontinuités (gaps), vous devez au préalable les aligner (menu "Actions / Aligner").
Séquences alignées
Séquences après action de l'enzyme :
Ouvrir la banque d'enzymes
Type de tableau :
noms complets des séquences dans la 1ère ligne
Le type de tableau de comparaison choisi () ne permet pas la construction d'un phénogramme (arbre matérialisant le degré de similitude entre les séquences).
Veuillez en choisir un autre dans la fenêtre "Tableau de comparaison".
Remarque : si la topologie d'un phénogramme paraît aberrante, vous pouvez également essayer d'utiliser une autre méthode d'alignement (Options / Algorithme d'alignement). Si les séquences sont très différentes notamment, l'algorithme "Diagonal" peut donner de meilleurs résultats.
Fichier
Edition
Actions
Affichage
Options
P.Cosentino / P.Pillot, v0.0 (infos RGPD)
Ouvrir la banque de séquences (Alt B)
Saisir/coller une séquence
Exporter
►
A propos
Quitter l'application
Tout sélectionner (Ctrl A)
Tout désélectionner (Ctrl 0)
Copier les séquences sélectionnées (Ctrl C)
Supprimer les séquences sélectionnées (Suppr)
Supprimer toutes les séquences (Alt Suppr)
D'autres actions sont possibles par un clic droit.
Décocher "Enzymes de restriction" pour pouvoir à nouveau aligner les séquences.
Aligner les séquences (Alt A)
Réaliser un DotPlot (2 séquences)
Transcrire les séquences
►
Traduire les séquences
►
Convertir en brin complémentaire
Inverser les séquences
Enzymes de restriction
Seules les séquences sélectionnées seront concernées par ces actions. D'autres actions sont possibles par un clic droit.